萨摩耶因为骨架小而脆弱 先天疾病刻意改良的 ，容易有脑水肿、病气、兔唇。难产深圳萨摩耶小型萨摩耶的骨盆窄，容易难产。心丝虫户外生活的萨摩耶，或蚊子多的地方，得到的机率比较大。便秘骨头和肉吃大多，缺少运动的萨摩耶容易因便秘而食欲变差。
　　1.皮肤病—— 皮肤与皮肤容易摩擦而容易藏污纳垢，造成皮脂漏。
　　2.外耳炎—— 耳道内毛密萨摩耶集的 容易因为耳道的通风不良而有外耳炎。
　　3.眼病——凸眼的 ，容易有睫毛倒插的毛病。 容易眼睑内翻。 容易泪管阻塞，而有两条明显的泪痕。
　　4.呼吸道疾病—— 容易喉头麻痹，气管萎缩，打呼噜。
　　5.牙齿疾病—— 萨摩耶，容易乳牙恒齿并排，塞住食宠物狗物碎屑，导致牙结石、牙周病，口臭，最后掉牙。嗜吃软食物的萨摩耶，容易因牙结石、口臭、牙痛而挑食。