留学生可以入学的日本高等教育机构有5种，即大学(本科）、大学院(即研究生院）、短期大学、专修学校专业课程和高等专门学校。
    一、大学本科
    修业年限为4年。但医学、牙科学和兽医学为6年。

　  二、短期大学
　  修业年限为2年或3年。
    家政、人文、教育及社会方面的专业占多数。
　 　
    三、大学院（即研究生院）
　　硕士课程:修业年限为2年。
　 博士课程:修业年限为5年。大多分为前期课程(2年:相当于上述硕士课程）和后期课程(3年）。但医学、牙科学和兽医学的博士课程(在学完医学、牙科学和兽医学系的6年课程后可以升学）的修业年限为4年。也有的大学开设5年一贯制的博士课程或只设后期3年的博士课程。
　　此外，有些大学和大学院(即研究生院）除正式学生外，还设置有单科生、旁听生和研修生等制度。
　　单科生:选修特定的科目，可取得学分。
　　旁听生:可旁听特定的科目，但不能取得学分。
　　研修生:在一定期间内，从事特定的专业项目的研究。

　   四、专修学校（专科学校）
　　专修学校中设有专业课程的又被称为"专门学校"，属高等教育机构。专门学校进行职业教育，并教授实际生活所需的技术、知识和技能。修业年限为1年以上，通常以2年课程为主。

　　五、高等专门学校（即中专）
　　高等专门学校以初中毕业生为对象，进行5年(与商船有关的学科为5年6个月）一贯制教育，其目的在于培养必要的职业能力。高等专门学校除工业方面的学科外，还设置与商船有关的学科及其它领域的学科。